108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5222 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  85.11 
 
 
401 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  100 
 
 
382 aa  786    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  71.27 
 
 
368 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  71.27 
 
 
368 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  70.99 
 
 
368 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  71.07 
 
 
369 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  70.7 
 
 
357 aa  529  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  68.07 
 
 
361 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  68.07 
 
 
361 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  68.07 
 
 
361 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  66.67 
 
 
360 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  60.87 
 
 
400 aa  495  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  56.8 
 
 
413 aa  464  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  57.47 
 
 
469 aa  460  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  56.04 
 
 
427 aa  451  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  55.91 
 
 
413 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  55.91 
 
 
413 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  55.91 
 
 
413 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  53.73 
 
 
440 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  55.47 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  56.25 
 
 
415 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  56.18 
 
 
400 aa  428  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  50.65 
 
 
418 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  54.14 
 
 
380 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  49.25 
 
 
428 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  53.13 
 
 
380 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  50.58 
 
 
356 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  51.45 
 
 
360 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  48.6 
 
 
394 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  49.3 
 
 
408 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  51.59 
 
 
401 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  47.55 
 
 
409 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  50 
 
 
452 aa  363  2e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  49.01 
 
 
384 aa  362  8e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  48.01 
 
 
391 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  48.88 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  48.28 
 
 
378 aa  357  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  49.86 
 
 
452 aa  356  3.9999999999999996e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  52.8 
 
 
760 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  47.09 
 
 
369 aa  349  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  47.09 
 
 
369 aa  349  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  46.69 
 
 
377 aa  348  7e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  46.24 
 
 
345 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  47.89 
 
 
400 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  45.63 
 
 
380 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  42.36 
 
 
464 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  42.36 
 
 
464 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  42.36 
 
 
464 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  41.03 
 
 
464 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  45.95 
 
 
357 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  43.14 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  41.93 
 
 
373 aa  318  9e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  41.02 
 
 
382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  41.9 
 
 
370 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  42.21 
 
 
448 aa  301  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  42.2 
 
 
387 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  41.67 
 
 
370 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  42.98 
 
 
360 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  41.67 
 
 
362 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  24.48 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  37.61 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  24.56 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  25.11 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  26.4 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  33.33 
 
 
485 aa  73.6  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  25.44 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  25.71 
 
 
364 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  23.91 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  26.45 
 
 
459 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  26.81 
 
 
364 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  25.1 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  32.35 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  24.21 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  25.67 
 
 
469 aa  66.2  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  25.08 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  23.12 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  23.7 
 
 
356 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  26.09 
 
 
491 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  35.48 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  23.35 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  26.67 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  26.07 
 
 
364 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  25.51 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  29.37 
 
 
347 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  34.83 
 
 
346 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  31.46 
 
 
362 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  32.35 
 
 
341 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  22.59 
 
 
381 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  38.16 
 
 
357 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  31.53 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  24.63 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  29.37 
 
 
347 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  26.44 
 
 
321 aa  56.6  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  30.56 
 
 
366 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  21.91 
 
 
378 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  36.62 
 
 
366 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  24.77 
 
 
360 aa  49.7  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  30.77 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  24.29 
 
 
466 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>