82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2863 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  100 
 
 		 360 aa  740    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  64.27 
 
 		 379 aa  461  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  63.43 
 
 		 379 aa  461  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  50.83 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  50.69 
 
 		 366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  54.62 
 
 		 361 aa  339  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  32.13 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  31.86 
 
 		 364 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  32.69 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  27.67 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  31.86 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  25.2 
 
 		 356 aa  132  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  30.89 
 
 		 426 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  26.82 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  25.88 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  26.53 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  28.57 
 
 		 371 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  25.33 
 
 		 366 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  27.56 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  25.68 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  26.16 
 
 		 360 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  26.04 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  25.36 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  28.68 
 
 		 491 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  27.18 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  28.73 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  27.18 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  25.07 
 
 		 469 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  25.71 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  25.49 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  29.43 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  28.57 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  24.66 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  24.83 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  22.11 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  24.4 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4025  putative linoleoyl-CoA desaturase  60.78 
 
 		 55 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  22.87 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  22.6 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  22.6 
 
 		 361 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  22.6 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  22.6 
 
 		 361 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  22.6 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  22.6 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  22.6 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  24.29 
 
 		 384 aa  53.5  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  22.6 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  22.6 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  25.63 
 
 		 485 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  21.94 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  22.19 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  24.77 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  24.77 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  24.77 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  22.22 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  21.03 
 
 		 453 aa  50.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  24.83 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  24.05 
 
 		 356 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  26.53 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  22.67 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  24.36 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  26.53 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  20.7 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  20.7 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  23.45 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  21.22 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  27.51 
 
 		 760 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  21.98 
 
 		 427 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  23.84 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  25.11 
 
 		 452 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  23.04 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  25.18 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  21.11 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  29.23 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  25.65 
 
 		 369 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  20.82 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  21.91 
 
 		 400 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  27.34 
 
 		 349 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  24.69 
 
 		 517 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  22.82 
 
 		 573 aa  42.7  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  24.39 
 
 		 365 aa  42.7  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  25.15 
 
 		 357 aa  42.7  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>