50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83317 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  100 
 
 		 573 aa  1195    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  47.53 
 
 		 545 aa  523  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  37.85 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  34.9 
 
 		 498 aa  211  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  27.53 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  27.07 
 
 		 477 aa  113  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  25.59 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  26.63 
 
 		 364 aa  103  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  27.31 
 
 		 368 aa  103  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  27.24 
 
 		 360 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  26.55 
 
 		 357 aa  100  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  25.97 
 
 		 365 aa  98.6  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  25.46 
 
 		 370 aa  98.6  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  27.82 
 
 		 342 aa  97.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  27.54 
 
 		 357 aa  94  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  25.76 
 
 		 346 aa  90.9  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  25.86 
 
 		 321 aa  90.5  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  24.82 
 
 		 347 aa  90.1  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  25.36 
 
 		 346 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  26.71 
 
 		 366 aa  87.8  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  24.22 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  24.73 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  26.89 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  26.32 
 
 		 341 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  26.53 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  23.08 
 
 		 366 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  24.86 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  23.96 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  20.72 
 
 		 485 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  22.86 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  23.91 
 
 		 386 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  25.09 
 
 		 366 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  37.1 
 
 		 360 aa  54.3  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  25.08 
 
 		 356 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  30.86 
 
 		 448 aa  52  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  24.14 
 
 		 378 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  23.79 
 
 		 371 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  22.95 
 
 		 365 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  24.32 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  36.07 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  22.91 
 
 		 363 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  22.49 
 
 		 453 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  31.51 
 
 		 356 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  21.35 
 
 		 394 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  23.64 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  38 
 
 		 659 aa  44.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  22.66 
 
 		 372 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  34.69 
 
 		 627 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  25.09 
 
 		 362 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  37.7 
 
 		 380 aa  43.5  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>