81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4136 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  100 
 
 		 379 aa  783    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  88.1 
 
 		 379 aa  675    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  63.43 
 
 		 360 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  49.44 
 
 		 363 aa  358  7e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  49.59 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  51.54 
 
 		 361 aa  337  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  28.66 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  30 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  29.05 
 
 		 426 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  29.91 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  28.41 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  30.3 
 
 		 364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  26.93 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  26.67 
 
 		 366 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  26.82 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  26.23 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  28.08 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  27.86 
 
 		 491 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  27.17 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  26.03 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  23.61 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  25 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  26.83 
 
 		 378 aa  93.2  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  24.23 
 
 		 363 aa  86.3  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  26.81 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  26.81 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  28.36 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  25.07 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  23.94 
 
 		 321 aa  57  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  24.54 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  22.85 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4025  putative linoleoyl-CoA desaturase  54.9 
 
 		 55 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  25.9 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  25.42 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  29.84 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  28.95 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  27.27 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  23.95 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  22.53 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  26.01 
 
 		 348 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  26.14 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  23.98 
 
 		 485 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  26.41 
 
 		 354 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  25.3 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  22.22 
 
 		 361 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  23.58 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  22.15 
 
 		 360 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  26.6 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  27.51 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  24.74 
 
 		 517 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  30 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  25.5 
 
 		 374 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  25.56 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  22.99 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  21.8 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  22.82 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  21.8 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  21.8 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  21.8 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  21.8 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  21.8 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  34.67 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  21.7 
 
 		 573 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  23.87 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  22.33 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  21.8 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  22.95 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  27.27 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  27.2 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  19.8 
 
 		 453 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  22.03 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  27.35 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  21.29 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  25.45 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  21.77 
 
 		 498 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  21.6 
 
 		 361 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  26.22 
 
 		 376 aa  43.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  25.99 
 
 		 760 aa  43.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  27.35 
 
 		 353 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  38.18 
 
 		 313 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  38.18 
 
 		 410 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>