97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0399 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  100 
 
 
349 aa  705    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  84.37 
 
 
349 aa  589  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  64.88 
 
 
349 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  63.39 
 
 
354 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  60.65 
 
 
374 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  58.19 
 
 
357 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  61.26 
 
 
376 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  63.01 
 
 
352 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  57.1 
 
 
348 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  62.07 
 
 
353 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  46.95 
 
 
343 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  46.04 
 
 
343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  46.95 
 
 
343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  46.65 
 
 
343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  45.73 
 
 
343 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  46.65 
 
 
343 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  46.34 
 
 
343 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  44.05 
 
 
351 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  49.17 
 
 
319 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  49.17 
 
 
319 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  48.84 
 
 
319 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  47.45 
 
 
328 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  44.54 
 
 
358 aa  275  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  45.59 
 
 
358 aa  272  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  46.89 
 
 
356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  35.99 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  37.08 
 
 
348 aa  165  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  30.41 
 
 
370 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  30.12 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14121  Fatty acid desaturase, type 2  29.68 
 
 
361 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  30.55 
 
 
335 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  30.72 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  25.93 
 
 
368 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  27.57 
 
 
368 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  31.01 
 
 
368 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  26.97 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  28.1 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  28.83 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  27.37 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  25.72 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  25.36 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  30.38 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  27.02 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  26.21 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  25.81 
 
 
352 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  24.32 
 
 
495 aa  62.8  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  25.65 
 
 
380 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  24.92 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  26.12 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  27.42 
 
 
424 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  25 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  22.82 
 
 
374 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  22.82 
 
 
374 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  27 
 
 
424 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  27 
 
 
424 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  27 
 
 
410 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  27 
 
 
426 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  27 
 
 
424 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  27 
 
 
313 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  25.5 
 
 
387 aa  59.7  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  27.73 
 
 
454 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  24.47 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  26 
 
 
435 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  24.59 
 
 
349 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  25.27 
 
 
349 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  30.17 
 
 
180 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  36.23 
 
 
380 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  34.29 
 
 
388 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  23.87 
 
 
448 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  30.21 
 
 
436 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  28.95 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  25.57 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  31.18 
 
 
435 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  34.29 
 
 
344 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  38.46 
 
 
405 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  28.99 
 
 
391 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  30.49 
 
 
375 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  38.46 
 
 
405 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  24.45 
 
 
379 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  34.33 
 
 
471 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  25.31 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  28.97 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  32.99 
 
 
489 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  28.1 
 
 
330 aa  46.6  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  30.89 
 
 
311 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  26.95 
 
 
394 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  28.68 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  27.13 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  31.87 
 
 
362 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  32.5 
 
 
426 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  20.99 
 
 
498 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  33.33 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  33.05 
 
 
286 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  24.62 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  24.6 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  25.81 
 
 
345 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  36.62 
 
 
350 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>