45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5676 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  100 
 
 		 354 aa  729    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  33.33 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  31.43 
 
 		 365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  31.12 
 
 		 381 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  27.79 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  30.55 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  30.42 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  28 
 
 		 366 aa  125  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  27.59 
 
 		 365 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  25.65 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  27.48 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  28.21 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  28.66 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  28.66 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  24.07 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  28.91 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  28.01 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  25.08 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  26.69 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  26.69 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  25 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  24.92 
 
 		 465 aa  92.8  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  25.7 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  24.92 
 
 		 466 aa  92.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  26.32 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  26.39 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  22.6 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  21.63 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  22.55 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  24.16 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  24.02 
 
 		 517 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  25 
 
 		 434 aa  53.1  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  22.96 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  21.37 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  20.07 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  20.34 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  23.06 
 
 		 453 aa  49.3  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  22.63 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  22.29 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  23.98 
 
 		 485 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  21.47 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  20.61 
 
 		 346 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  22.69 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  21.15 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  19.24 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>