133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3764 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  100 
 
 
363 aa  750    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  56.74 
 
 
378 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  54.99 
 
 
381 aa  415  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  40.11 
 
 
365 aa  282  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  41.78 
 
 
366 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  38.59 
 
 
366 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  41.53 
 
 
360 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  37.22 
 
 
356 aa  246  6e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  31.68 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  32.69 
 
 
371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  31.11 
 
 
364 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  32.32 
 
 
364 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  32.3 
 
 
362 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  31.4 
 
 
426 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  31.25 
 
 
365 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  30.92 
 
 
386 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  29.66 
 
 
491 aa  166  8e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  27.79 
 
 
354 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  30.19 
 
 
466 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  30.19 
 
 
465 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  28.01 
 
 
469 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  25.36 
 
 
360 aa  99.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  27.67 
 
 
455 aa  97.8  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  25.23 
 
 
453 aa  96.3  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  25.37 
 
 
459 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  27.21 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  24.13 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  24.4 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  25.76 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  25.91 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  24.06 
 
 
363 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  26.55 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  25 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  25.14 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  27.02 
 
 
413 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  23.53 
 
 
368 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  23.53 
 
 
368 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  25.08 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  23.53 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  22.83 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  24.93 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  24.56 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  23.43 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  23.43 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  24.05 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  25.64 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  22.94 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  26.3 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  27.17 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  23.33 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  26.1 
 
 
485 aa  70.5  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  26.25 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  22.44 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  22.63 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  22.63 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  23.38 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  24.19 
 
 
517 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  23.82 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  25.54 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  25.09 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  23.08 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  26.39 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  24.55 
 
 
360 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  23.96 
 
 
469 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  24.23 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  23.65 
 
 
440 aa  67  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  27.84 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  24.83 
 
 
387 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  24.48 
 
 
428 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  22.25 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  22.37 
 
 
448 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  22.12 
 
 
434 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  25.29 
 
 
360 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  25.67 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  22.54 
 
 
408 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  24.56 
 
 
362 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  25.08 
 
 
360 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  26.2 
 
 
380 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  22.67 
 
 
418 aa  60.1  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  26.2 
 
 
380 aa  59.7  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  23.08 
 
 
382 aa  59.7  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  23.95 
 
 
464 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  24.64 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  23.21 
 
 
397 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  24.65 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  24.56 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  23.42 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  24.55 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  24.55 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  24.55 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  24.55 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  24.55 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  24.55 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  24.55 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  24.57 
 
 
366 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  24.55 
 
 
361 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  24.55 
 
 
361 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  24 
 
 
361 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  24 
 
 
361 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  24.19 
 
 
361 aa  56.2  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>