118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5677 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  100 
 
 		 365 aa  749    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  33.15 
 
 		 360 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  32.58 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  30.96 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  31.49 
 
 		 366 aa  189  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  31.25 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  30.89 
 
 		 362 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  28.21 
 
 		 426 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  28.45 
 
 		 366 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  29.16 
 
 		 364 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  29.78 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  31.44 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  29.43 
 
 		 364 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  31.43 
 
 		 354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  28.65 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  30.73 
 
 		 378 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  28.65 
 
 		 356 aa  146  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  27.05 
 
 		 363 aa  133  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  27.67 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  26.26 
 
 		 491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  26.08 
 
 		 366 aa  126  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  27.14 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  25.61 
 
 		 466 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  25.61 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  26.93 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  26.96 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  25.27 
 
 		 361 aa  99.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  25.67 
 
 		 455 aa  90.1  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  26.55 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  24.58 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  22.81 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  28 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  23.19 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  27.61 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  20.58 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  22.96 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  25.35 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  21.89 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  26.77 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  23.68 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  24.26 
 
 		 452 aa  62.8  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  22.92 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  25 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  22.03 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  22.03 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  22.79 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  22.56 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  21.26 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  23.1 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  23.99 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  22.61 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  22.04 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  22.41 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  23.17 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  22.1 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  24.08 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  23.02 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  22.35 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  23.79 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  21.94 
 
 		 384 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  21.59 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  22.91 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  22.91 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  22.91 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  22.83 
 
 		 535 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  22.91 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  22.91 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  22.91 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  22.91 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  24 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  23.91 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  22.91 
 
 		 361 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  22.91 
 
 		 361 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  21.65 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  21.69 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  20.88 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  21.47 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  22.18 
 
 		 361 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  23.66 
 
 		 498 aa  53.1  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  24.64 
 
 		 347 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  23.62 
 
 		 366 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  22.22 
 
 		 400 aa  52.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  23.6 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  18.79 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  23.48 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  24.02 
 
 		 448 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  21.25 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  24.26 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  22.45 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  26.22 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  24.09 
 
 		 347 aa  50.4  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  21.19 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  23.86 
 
 		 469 aa  49.7  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  21.69 
 
 		 358 aa  49.7  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  32.69 
 
 		 374 aa  49.7  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  32.69 
 
 		 374 aa  49.7  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  22.5 
 
 		 365 aa  49.3  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  22.95 
 
 		 573 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  24.22 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  23.91 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>