145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2414 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  100 
 
 
321 aa  660    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  60 
 
 
365 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  59.75 
 
 
358 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  51.5 
 
 
368 aa  323  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  51.1 
 
 
362 aa  318  6e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  51.64 
 
 
357 aa  315  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  50.31 
 
 
366 aa  314  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  52.2 
 
 
362 aa  308  8e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  50.47 
 
 
364 aa  302  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  47.45 
 
 
366 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  44.97 
 
 
357 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  46.69 
 
 
360 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  49.67 
 
 
370 aa  258  7e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  42.32 
 
 
347 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  42.66 
 
 
346 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  42.43 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  41.61 
 
 
346 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  42.72 
 
 
347 aa  229  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  44.74 
 
 
375 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  34.02 
 
 
342 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  28.18 
 
 
477 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  29.43 
 
 
366 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  29.79 
 
 
361 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  25 
 
 
545 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  26.95 
 
 
498 aa  93.6  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  25.86 
 
 
573 aa  90.9  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  26.58 
 
 
535 aa  87  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  29.34 
 
 
517 aa  86.3  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  25 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  27.54 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  26.47 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  25.25 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  26.4 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  26.55 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  28.17 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  24.46 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  27.72 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  26.01 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  25.59 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  21.55 
 
 
366 aa  67  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  25.1 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  25.1 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  27.22 
 
 
426 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  25.1 
 
 
368 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  26.02 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  25.08 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  25.71 
 
 
378 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  23.75 
 
 
448 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  25.49 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  25.67 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  25.49 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  25.49 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  21.53 
 
 
485 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  21.4 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  25.8 
 
 
469 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  26.84 
 
 
466 aa  59.7  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  26.84 
 
 
465 aa  59.3  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  25.33 
 
 
455 aa  59.3  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  24.23 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  25.85 
 
 
363 aa  57  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  20.76 
 
 
360 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  23.22 
 
 
386 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  29.06 
 
 
400 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  25.51 
 
 
469 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  24.29 
 
 
464 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  24.29 
 
 
464 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  24.29 
 
 
464 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  25.3 
 
 
382 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  24.19 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  23.23 
 
 
452 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  24.41 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  21.05 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  32.22 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  31.46 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  23.88 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  27.57 
 
 
760 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  20.76 
 
 
361 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  24.1 
 
 
360 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  20.76 
 
 
361 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  20.76 
 
 
361 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  20.76 
 
 
361 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  20.76 
 
 
361 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  27.55 
 
 
391 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  20.76 
 
 
361 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  31.43 
 
 
374 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  20.76 
 
 
361 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  21.05 
 
 
361 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  32.04 
 
 
464 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  24.43 
 
 
400 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  28.87 
 
 
418 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  20.76 
 
 
361 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  26.05 
 
 
401 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  23.92 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  30.17 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  24.56 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.26 
 
 
765 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  24.83 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  31.03 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  23.79 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  30.85 
 
 
440 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>