147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3204 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  100 
 
 
360 aa  747    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  44.88 
 
 
366 aa  338  8e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  45.53 
 
 
366 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  43.79 
 
 
365 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  45.22 
 
 
381 aa  310  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  42.58 
 
 
378 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  41.53 
 
 
363 aa  264  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  37.71 
 
 
356 aa  250  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  34.52 
 
 
362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  35.69 
 
 
364 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  34.25 
 
 
364 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  35.07 
 
 
426 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  35.03 
 
 
364 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  36.34 
 
 
371 aa  220  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  33.15 
 
 
365 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  30.34 
 
 
386 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  31.58 
 
 
491 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  27.78 
 
 
466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  27.78 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  28.21 
 
 
354 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  27.43 
 
 
459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  25.55 
 
 
453 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  24.66 
 
 
360 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  28.93 
 
 
485 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  25.62 
 
 
469 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  25.72 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  25.72 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  28.87 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  26.4 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  26.71 
 
 
366 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  23.99 
 
 
455 aa  84  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  27.17 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  28.07 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  26.67 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  28.19 
 
 
387 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  28.74 
 
 
517 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  25.6 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  25.83 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  28.93 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  27.86 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  24.91 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  24.17 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  25.09 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  24.13 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  25.86 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  24.91 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  24.91 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  25.77 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  27.35 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  25.15 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  25.15 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  27.88 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  26.4 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  25.58 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  26.11 
 
 
448 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  23.24 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  28.34 
 
 
760 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  24.12 
 
 
380 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  22.88 
 
 
380 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  25.89 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  23.98 
 
 
391 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  26.99 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  26.54 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  26.86 
 
 
378 aa  65.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  24.81 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  23.32 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  25.72 
 
 
368 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  26.35 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  26.2 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  23.38 
 
 
380 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  27.65 
 
 
360 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  25.85 
 
 
401 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  24.18 
 
 
368 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  23.5 
 
 
368 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  23.5 
 
 
368 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  24.02 
 
 
452 aa  63.5  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  25.86 
 
 
428 aa  63.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  23.88 
 
 
477 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  24.76 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  25.37 
 
 
342 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  26.5 
 
 
364 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  22.74 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  26.61 
 
 
400 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  23.64 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  24.46 
 
 
400 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  26.79 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  26.22 
 
 
464 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  25.88 
 
 
413 aa  56.6  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  24.26 
 
 
469 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  24.57 
 
 
440 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  25.29 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  25.36 
 
 
498 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  22.42 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  22.88 
 
 
485 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  23.97 
 
 
361 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  23.97 
 
 
361 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  23.97 
 
 
361 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  32.52 
 
 
380 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  24.66 
 
 
357 aa  53.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  22.53 
 
 
535 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>