91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3401 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  100 
 
 		 372 aa  758    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  82 
 
 		 372 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  68.99 
 
 		 360 aa  531  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  68.16 
 
 		 361 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  68.16 
 
 		 361 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  67.03 
 
 		 361 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  68.16 
 
 		 361 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  69.74 
 
 		 361 aa  524  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  67.58 
 
 		 361 aa  522  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  67.88 
 
 		 361 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  67.88 
 
 		 361 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  67.88 
 
 		 361 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  67.88 
 
 		 361 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1073  fatty acid desaturase  40.84 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000383129  normal  0.912357 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2289  fatty acid desaturase  46.33 
 
 		 359 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345103  hitchhiker  0.00338003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  32.21 
 
 		 362 aa  176  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1829  fatty acid desaturase  34.06 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  23.1 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  23.88 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  27.38 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  25.29 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  24.93 
 
 		 475 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  25.63 
 
 		 469 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  23.58 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  25.74 
 
 		 363 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  22.45 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  30.83 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  33.93 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  23.97 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  23.42 
 
 		 517 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  22.75 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  22.79 
 
 		 426 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  25.76 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  27.66 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  24.14 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  23.94 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  25.8 
 
 		 455 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  24.17 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  23.47 
 
 		 498 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.43 
 
 		 765 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  25.19 
 
 		 330 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  23.61 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  25 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  23.94 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  23.74 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  20.95 
 
 		 357 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  20.28 
 
 		 365 aa  46.6  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  21.09 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  24.71 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  23.45 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  24.02 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  24.61 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  22.51 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  26.89 
 
 		 540 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  23.59 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  23.34 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  22.79 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  25.11 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  27.22 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  25.26 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  23.91 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  23.91 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  23.99 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  22.51 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  22.66 
 
 		 573 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  23.28 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  23.15 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  22.04 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  28.1 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  21.09 
 
 		 321 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  24.37 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  23.58 
 
 		 459 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  23.15 
 
 		 360 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  27 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  22.34 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  21.2 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  23.15 
 
 		 360 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  23.05 
 
 		 362 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  24.49 
 
 		 393 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  20.97 
 
 		 352 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  26.94 
 
 		 329 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  30.23 
 
 		 465 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  30.23 
 
 		 466 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  25.2 
 
 		 321 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  20.97 
 
 		 352 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  21.51 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  26.59 
 
 		 485 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  26.62 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  26.62 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  26.62 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  26.62 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>