134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30440 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  100 
 
 		 357 aa  732    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  66.09 
 
 		 364 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  56.98 
 
 		 366 aa  418  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  54.55 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  51.56 
 
 		 366 aa  362  6e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  51.42 
 
 		 357 aa  355  5.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  52.54 
 
 		 368 aa  351  8.999999999999999e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  51.31 
 
 		 365 aa  348  9e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  53.18 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  50.14 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  51.64 
 
 		 321 aa  315  6e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  43.91 
 
 		 362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  44.21 
 
 		 360 aa  292  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  45.07 
 
 		 347 aa  292  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  47.46 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  43.27 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  44.78 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  38.97 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  37.5 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  32.62 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  30.49 
 
 		 477 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  26.4 
 
 		 545 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  25.21 
 
 		 573 aa  101  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  31.68 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  26.76 
 
 		 535 aa  99.4  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  28.78 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  25.35 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  26.36 
 
 		 469 aa  79.7  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  27.27 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  26.21 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  22.59 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  24.93 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  25 
 
 		 400 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  25 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  26.38 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  27.46 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  27.46 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  27.46 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  37.04 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  25.52 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  26.04 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  28.62 
 
 		 469 aa  67  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  25.74 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  25.08 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  24.39 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  23.93 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  26.44 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  24.4 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  28.95 
 
 		 760 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  38.89 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  25.9 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  27.71 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  25.9 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  25.48 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  26.09 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  24.76 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  24.7 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  29.79 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  26.42 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  26.44 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  23.48 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  40.28 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  39.74 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  39.39 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  38.46 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  31.52 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  25.35 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  37.35 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  38.67 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  24.8 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  25.41 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  23.96 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  25.19 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  25.76 
 
 		 409 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  27.18 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  24.84 
 
 		 459 aa  57  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  33.72 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  23.38 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  23.3 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  25.86 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  35.63 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  25.45 
 
 		 408 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  35.9 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  27.78 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  27.78 
 
 		 465 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  21.74 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  25.66 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  24.44 
 
 		 384 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  24.7 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  25.09 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  25.61 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  24.7 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  24.7 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  23.14 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  24.24 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  25.26 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  25.26 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  25.26 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  25.26 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  24.75 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>