110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1276 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  100 
 
 
369 aa  769    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  100 
 
 
369 aa  769    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  84.62 
 
 
377 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  96.04 
 
 
380 aa  751    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  85.47 
 
 
345 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  70.43 
 
 
378 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  58.15 
 
 
400 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  59.25 
 
 
390 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  58.09 
 
 
360 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  56.23 
 
 
401 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  51.73 
 
 
357 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  52.46 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  54.46 
 
 
760 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  51.59 
 
 
380 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  52.02 
 
 
380 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  51.27 
 
 
413 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  53.3 
 
 
373 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  50.86 
 
 
408 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  52.41 
 
 
382 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  50.14 
 
 
356 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  51.15 
 
 
394 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  50.57 
 
 
397 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  51.15 
 
 
452 aa  381  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  47.33 
 
 
391 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  47.22 
 
 
409 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  44.17 
 
 
464 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  44.17 
 
 
464 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  44.17 
 
 
464 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  45.16 
 
 
464 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  47.19 
 
 
469 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  47.43 
 
 
384 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  48.63 
 
 
387 aa  363  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  46.35 
 
 
440 aa  363  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  47.38 
 
 
400 aa  361  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  51.3 
 
 
370 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  47.69 
 
 
401 aa  358  9e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  47.73 
 
 
452 aa  355  5e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  47.73 
 
 
418 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  48.06 
 
 
418 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  46.84 
 
 
413 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  51.3 
 
 
362 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  46.84 
 
 
413 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  46.84 
 
 
413 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  51.15 
 
 
360 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  48.03 
 
 
415 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  46.09 
 
 
357 aa  343  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  43.75 
 
 
368 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  43.75 
 
 
368 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  47.09 
 
 
382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  45.98 
 
 
427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  43.75 
 
 
368 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  46.96 
 
 
361 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  46.67 
 
 
361 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  46.67 
 
 
361 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  44.77 
 
 
369 aa  334  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  44.47 
 
 
428 aa  332  8e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  45.24 
 
 
360 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  43.75 
 
 
370 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  42.27 
 
 
448 aa  316  5e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  28.86 
 
 
356 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  25.62 
 
 
366 aa  98.2  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  26.11 
 
 
366 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  26.12 
 
 
417 aa  86.3  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  23.98 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  28.03 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  28.22 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  27.15 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  23.43 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  25.15 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  24.41 
 
 
453 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  26.87 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  26.64 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  27.03 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  24.89 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  25.29 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  27.23 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  27.11 
 
 
364 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  25.8 
 
 
491 aa  67  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  24.6 
 
 
381 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  24.77 
 
 
466 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  24.77 
 
 
465 aa  65.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  26.06 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  31.82 
 
 
443 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  25.9 
 
 
357 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  26.1 
 
 
366 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  25.35 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  23.3 
 
 
459 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  37.18 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  22.03 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  34.88 
 
 
357 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  36.14 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  38.75 
 
 
375 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  24.2 
 
 
368 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  37.18 
 
 
362 aa  59.7  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  35.23 
 
 
366 aa  59.7  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  24.47 
 
 
469 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  23.32 
 
 
485 aa  57  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  30.77 
 
 
346 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  21.64 
 
 
386 aa  53.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
341 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>