144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3373 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  100 
 
 
346 aa  711    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  95 
 
 
341 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  44.41 
 
 
360 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  39.76 
 
 
347 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  42.51 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  39.82 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  43.64 
 
 
346 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  41.61 
 
 
321 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  38.37 
 
 
365 aa  245  6.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  39.22 
 
 
358 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  37.98 
 
 
366 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  39.94 
 
 
364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  38.72 
 
 
357 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  40.12 
 
 
362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  37.2 
 
 
368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  38.65 
 
 
366 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  37.5 
 
 
357 aa  226  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  40.37 
 
 
370 aa  223  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  37.12 
 
 
342 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  38.12 
 
 
375 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  30.66 
 
 
477 aa  184  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  28.69 
 
 
535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  27.27 
 
 
545 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  27.58 
 
 
361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  29.05 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  25.07 
 
 
573 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  26.71 
 
 
434 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  26.2 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  24.2 
 
 
498 aa  89.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  23.94 
 
 
400 aa  89.4  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  24 
 
 
485 aa  80.1  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  26.15 
 
 
469 aa  79.7  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  27.95 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  28.3 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  27.48 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  25.14 
 
 
517 aa  76.3  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  27.91 
 
 
469 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  27.27 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  27.09 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  26.56 
 
 
426 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  26.56 
 
 
357 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  38.6 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  26.59 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  25.41 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  28.69 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  34.31 
 
 
382 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  28.62 
 
 
466 aa  67  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  28.62 
 
 
465 aa  67.4  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  27.38 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  26.52 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  27.74 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  25.68 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  24.92 
 
 
356 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  27.05 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  24.8 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  23.91 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  25.81 
 
 
401 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  30.14 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  36.84 
 
 
452 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  25.17 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  22.94 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  23.9 
 
 
368 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  23.9 
 
 
368 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  23.9 
 
 
368 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  23.79 
 
 
369 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  23.79 
 
 
369 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  23.98 
 
 
345 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  24.57 
 
 
361 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  24.57 
 
 
361 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  24.5 
 
 
361 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  28.05 
 
 
427 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  28.87 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  34.65 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  28.52 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  35.71 
 
 
400 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  38.1 
 
 
415 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  24.36 
 
 
760 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  25.95 
 
 
370 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  24.61 
 
 
362 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  30 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  25.09 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  30.09 
 
 
397 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  29.09 
 
 
485 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  28.79 
 
 
443 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  36.23 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  26.03 
 
 
361 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  26.03 
 
 
361 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  26.03 
 
 
361 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  30.71 
 
 
417 aa  57.4  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  26.72 
 
 
360 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  25.34 
 
 
378 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  26.03 
 
 
361 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  25.93 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  25.93 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  25.68 
 
 
361 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  25.68 
 
 
361 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  25.27 
 
 
459 aa  56.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  25.68 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  36.23 
 
 
464 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  24.78 
 
 
408 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>