127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3679 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  100 
 
 		 347 aa  697    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  89.63 
 
 		 347 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  60 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  51.49 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  46.83 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  46.78 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  44.78 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  48.04 
 
 		 364 aa  282  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  46.57 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  44.98 
 
 		 365 aa  275  9e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  44.24 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  42.6 
 
 		 366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  41.84 
 
 		 368 aa  270  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  41.89 
 
 		 357 aa  260  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  40.43 
 
 		 362 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  42.72 
 
 		 321 aa  255  6e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  40.36 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  40.65 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  46.04 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  37.61 
 
 		 342 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  32.12 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  31.4 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  29.08 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  25.94 
 
 		 545 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  26.45 
 
 		 535 aa  106  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  27.06 
 
 		 573 aa  94.7  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  29.39 
 
 		 455 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  25.3 
 
 		 498 aa  86.3  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  26.25 
 
 		 469 aa  79.7  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  29.83 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  24.41 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  25 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  26.23 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  22.09 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  29.04 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  27.78 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  22.35 
 
 		 485 aa  66.6  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  28.52 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  28.52 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  27.59 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  28.93 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  25.42 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  25 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  49.21 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  26.47 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  49.12 
 
 		 760 aa  62.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  24.66 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  24.66 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  41.94 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  29.11 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  29.11 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  28.69 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  24.66 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  29.37 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  46.88 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  23.59 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  26.07 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  24.71 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  40.32 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  24.02 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  40.32 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  41.54 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  28.84 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  32.35 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  24.21 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  28.06 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  24.5 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  32.56 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  29.08 
 
 		 485 aa  56.2  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  25 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  28.76 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  41.27 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  23.47 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  24.61 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  25.44 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  23.3 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  25.6 
 
 		 427 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  22.83 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  23.15 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  23.15 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  23.15 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  26.7 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  22.83 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  23.15 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  23.15 
 
 		 361 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  23.15 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  30.86 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  29.41 
 
 		 440 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  25.33 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  38.81 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  28.44 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  25.42 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  25.97 
 
 		 466 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  27.98 
 
 		 390 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  30.86 
 
 		 415 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  25.78 
 
 		 465 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  20.52 
 
 		 336 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  39.66 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  40 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  42.11 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11671 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>