122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4056 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  100 
 
 
347 aa  693    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  89.63 
 
 
347 aa  587  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  60.59 
 
 
360 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  54.76 
 
 
346 aa  324  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  47.13 
 
 
366 aa  299  6e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  47.95 
 
 
362 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  45.07 
 
 
357 aa  291  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  49.24 
 
 
364 aa  286  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  44.21 
 
 
368 aa  279  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  44.55 
 
 
358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  43.77 
 
 
365 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  46.02 
 
 
370 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  41.69 
 
 
366 aa  261  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  40.12 
 
 
362 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  41.62 
 
 
357 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  42.32 
 
 
321 aa  249  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  39.76 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  40.06 
 
 
341 aa  242  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  44.82 
 
 
375 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  37.5 
 
 
342 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  31.84 
 
 
477 aa  168  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  30.58 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  29.35 
 
 
535 aa  123  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  25.94 
 
 
545 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  28.49 
 
 
361 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  26.99 
 
 
498 aa  94  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  25.09 
 
 
573 aa  93.2  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  26.99 
 
 
469 aa  86.3  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  28.35 
 
 
455 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  27.27 
 
 
469 aa  80.9  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  23.82 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  25.42 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  26.28 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  22.73 
 
 
485 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  27.54 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  22.16 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  23.83 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  27.84 
 
 
361 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  27.84 
 
 
361 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  25.6 
 
 
401 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  27.84 
 
 
361 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  27.08 
 
 
517 aa  63.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  24.5 
 
 
360 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  24.67 
 
 
361 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  24.67 
 
 
361 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  24.67 
 
 
361 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  24.67 
 
 
361 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  24.67 
 
 
361 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  24.75 
 
 
361 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  24.33 
 
 
361 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  24.33 
 
 
361 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  24.67 
 
 
361 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  27.68 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  23.88 
 
 
382 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  22.91 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  24.13 
 
 
368 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  24.13 
 
 
368 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  27.52 
 
 
364 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  23.69 
 
 
368 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  44.26 
 
 
760 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  25.98 
 
 
459 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  44.44 
 
 
443 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  23.71 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  28.23 
 
 
364 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  25 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  24.22 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  43.75 
 
 
417 aa  57.4  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  22.28 
 
 
366 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  24.49 
 
 
387 aa  56.2  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  22.83 
 
 
448 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  27.11 
 
 
360 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  21.73 
 
 
356 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  24.66 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  28.31 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  27.42 
 
 
364 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  23.63 
 
 
452 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  26.57 
 
 
453 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  35.48 
 
 
391 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  38.81 
 
 
356 aa  52.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  25.71 
 
 
401 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  28.01 
 
 
426 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  23.5 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  42.11 
 
 
345 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  39.66 
 
 
418 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  23.53 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  26.95 
 
 
485 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  35.48 
 
 
394 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  40.35 
 
 
377 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  25.6 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  25.48 
 
 
466 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  25.48 
 
 
465 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  23.82 
 
 
363 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  22.8 
 
 
382 aa  49.7  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  24.35 
 
 
373 aa  49.3  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  23.27 
 
 
378 aa  49.3  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  40.35 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  32.14 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  40.35 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  30.38 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  23.2 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>