114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2952 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  100 
 
 
361 aa  722    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  36.64 
 
 
366 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  33.75 
 
 
342 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  31.01 
 
 
368 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  29.59 
 
 
360 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  29.33 
 
 
357 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  28.49 
 
 
347 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  29.08 
 
 
347 aa  99.4  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  26.75 
 
 
346 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  29.79 
 
 
321 aa  98.6  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  27.57 
 
 
364 aa  97.1  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  27.65 
 
 
366 aa  97.1  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  29.62 
 
 
362 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  25.82 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  26.44 
 
 
341 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  29.93 
 
 
362 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  27.09 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  31.58 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  26.59 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  28.49 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  29.64 
 
 
365 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  32.54 
 
 
364 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  28.19 
 
 
371 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  26.1 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  24.76 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  29.15 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  26.16 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  26.09 
 
 
517 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  30.51 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  31.27 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  25.72 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  26.97 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  26.41 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  30.14 
 
 
426 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  31.06 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  26.96 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  27.88 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  28 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  30.28 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  25.29 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  25.29 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  23.62 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  26.03 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  24.83 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  21.78 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  25 
 
 
459 aa  63.5  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  23.44 
 
 
377 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  26.75 
 
 
391 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  24.51 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  26.81 
 
 
485 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  26.77 
 
 
465 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  22.87 
 
 
469 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  26.77 
 
 
466 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  24.01 
 
 
427 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  23.56 
 
 
418 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  28 
 
 
394 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  29.87 
 
 
361 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  29.87 
 
 
361 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  29.87 
 
 
361 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  24.47 
 
 
390 aa  59.3  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  27.71 
 
 
452 aa  59.7  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  24.64 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  24.21 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  22.91 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  23.03 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  25.24 
 
 
360 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  23.31 
 
 
477 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  23.21 
 
 
400 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  24.48 
 
 
360 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  24.48 
 
 
360 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  22.56 
 
 
413 aa  56.6  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  23.91 
 
 
360 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  25.23 
 
 
368 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  26.18 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  25.23 
 
 
368 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  25.08 
 
 
368 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  24.13 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  22.69 
 
 
535 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  23.62 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  24.55 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  25.15 
 
 
400 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  23.53 
 
 
415 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  23.67 
 
 
387 aa  53.5  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  26.99 
 
 
760 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  23.95 
 
 
380 aa  52.8  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  22.09 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  22.09 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  22.09 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  26.72 
 
 
469 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  26.29 
 
 
452 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  25.37 
 
 
362 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  26.46 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  25.65 
 
 
340 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  23.78 
 
 
378 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  24.57 
 
 
397 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  26.04 
 
 
370 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  24.34 
 
 
428 aa  49.7  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  25 
 
 
440 aa  49.7  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  27.03 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  25.08 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>