89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5160 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  100 
 
 		 348 aa  701    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  75.95 
 
 		 353 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  79.19 
 
 		 352 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  61.59 
 
 		 349 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  61.71 
 
 		 354 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  63.25 
 
 		 374 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  58.68 
 
 		 349 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  59.82 
 
 		 376 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  56.29 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  57.1 
 
 		 349 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  44.48 
 
 		 343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  45.78 
 
 		 351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  44.48 
 
 		 343 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  44.48 
 
 		 343 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  44.48 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  44.18 
 
 		 343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  44.82 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  44.82 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  46.15 
 
 		 319 aa  299  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  45.83 
 
 		 319 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  45.83 
 
 		 319 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  48.41 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  46.67 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  47.55 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  40.91 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  33.22 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  28.94 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  29.23 
 
 		 370 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  33.23 
 
 		 348 aa  149  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  31.68 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14121  Fatty acid desaturase, type 2  29.06 
 
 		 361 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  29.15 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  25.35 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  26.6 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  25.36 
 
 		 368 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  26.86 
 
 		 368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  27.05 
 
 		 359 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  26.49 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  27.34 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  24.07 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  24.07 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  29 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  28.88 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  27.04 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  27.04 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  27.04 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  27.04 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  27.04 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  26.78 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  26.64 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  26.8 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  27.2 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  24.62 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  25.45 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  26.89 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  26.32 
 
 		 454 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  24.11 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  25.17 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  24.11 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  23.81 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  27.78 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  25.89 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  25 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  26.62 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  26.83 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  34.83 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  35.29 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  36.47 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  23.75 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  24.13 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  26.18 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  24.84 
 
 		 435 aa  52.8  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  33.96 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  34.86 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  22.19 
 
 		 418 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  33.72 
 
 		 380 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  31.58 
 
 		 180 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  23.85 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  25.4 
 
 		 379 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  26.51 
 
 		 379 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  28.89 
 
 		 471 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  24.89 
 
 		 362 aa  46.2  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  38.46 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  29.81 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  21.94 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  23.69 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  27.59 
 
 		 436 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  25 
 
 		 363 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>