51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_06471 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  62.01 
 
 
375 aa  251  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  61.24 
 
 
391 aa  246  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  60.11 
 
 
380 aa  244  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  59.55 
 
 
388 aa  243  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  60.67 
 
 
344 aa  242  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  58.89 
 
 
405 aa  240  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  58.89 
 
 
405 aa  240  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  48.04 
 
 
387 aa  177  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  47.12 
 
 
495 aa  172  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  46.11 
 
 
362 aa  152  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  40.22 
 
 
436 aa  143  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  36 
 
 
381 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  36.9 
 
 
471 aa  112  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  38.46 
 
 
435 aa  101  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  33.72 
 
 
394 aa  101  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  32.31 
 
 
448 aa  96.7  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  38.4 
 
 
418 aa  89.4  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  28.77 
 
 
359 aa  82.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  28.49 
 
 
359 aa  78.2  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  34.13 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  29.46 
 
 
357 aa  72.4  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  24.82 
 
 
435 aa  57.8  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  32 
 
 
376 aa  57.8  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  32 
 
 
374 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  32.58 
 
 
357 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  34.15 
 
 
286 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  34.48 
 
 
328 aa  54.7  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  30.17 
 
 
349 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  30.21 
 
 
352 aa  52.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  25.38 
 
 
352 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  33.82 
 
 
358 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  33.82 
 
 
358 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  25.38 
 
 
352 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  24.36 
 
 
351 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  29 
 
 
350 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  30 
 
 
349 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  31.25 
 
 
356 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  40.91 
 
 
352 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  25.45 
 
 
349 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  35.21 
 
 
368 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  40.91 
 
 
353 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  32.69 
 
 
354 aa  44.7  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  24.72 
 
 
370 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  26.14 
 
 
349 aa  44.3  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  35.21 
 
 
368 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  30.51 
 
 
362 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  24.42 
 
 
370 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  26.26 
 
 
351 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  33.8 
 
 
368 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  30.99 
 
 
368 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>