89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48423 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  100 
 
 
495 aa  1026    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  54.69 
 
 
387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  53.7 
 
 
362 aa  398  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  48.99 
 
 
405 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  48.99 
 
 
405 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  46.27 
 
 
391 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  46.77 
 
 
388 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  48.13 
 
 
380 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  48.44 
 
 
375 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  47.93 
 
 
344 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  42.43 
 
 
381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  39.75 
 
 
436 aa  266  7e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  35.44 
 
 
448 aa  206  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  31.54 
 
 
418 aa  199  9e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  33.78 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  32.32 
 
 
471 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  33.51 
 
 
359 aa  179  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  33.79 
 
 
360 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  31.15 
 
 
359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  47.12 
 
 
180 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06461  hypothetical protein  54.07 
 
 
141 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.309597 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  29.97 
 
 
394 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  30.05 
 
 
357 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  27.18 
 
 
435 aa  108  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  23 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  25.79 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  26.15 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  22.61 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  22.61 
 
 
352 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  21.76 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  25.53 
 
 
376 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  25.28 
 
 
374 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  26.92 
 
 
354 aa  64.3  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  23.71 
 
 
358 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  32.46 
 
 
286 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  23.92 
 
 
358 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  24.32 
 
 
349 aa  62.4  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  26.89 
 
 
349 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  24.42 
 
 
351 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  25.28 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  25.87 
 
 
349 aa  60.1  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  24.72 
 
 
343 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  25.48 
 
 
357 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  22.63 
 
 
393 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  22.19 
 
 
374 aa  54.3  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  22.19 
 
 
374 aa  54.3  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  23.84 
 
 
380 aa  54.3  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  23.48 
 
 
343 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  23.48 
 
 
343 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  23.11 
 
 
343 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  23.11 
 
 
343 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  23.48 
 
 
343 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  22.26 
 
 
364 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  23.21 
 
 
454 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  21.3 
 
 
349 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  23.7 
 
 
328 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  26.13 
 
 
351 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  23.06 
 
 
362 aa  51.6  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  21.82 
 
 
346 aa  51.2  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  23.11 
 
 
343 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  23.11 
 
 
319 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  23.11 
 
 
319 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  23.11 
 
 
319 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  38.18 
 
 
352 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  38.18 
 
 
353 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  23.43 
 
 
424 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  21.21 
 
 
344 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1073  fatty acid desaturase  32.79 
 
 
362 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000383129  normal  0.912357 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  22.18 
 
 
368 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  34.43 
 
 
356 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  22.96 
 
 
368 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  23.16 
 
 
424 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  23.16 
 
 
424 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  23.16 
 
 
424 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  23.16 
 
 
426 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  23.16 
 
 
410 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  27.1 
 
 
320 aa  47  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  26.62 
 
 
348 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  40 
 
 
363 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  38.46 
 
 
362 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
330 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  22.43 
 
 
370 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  22.96 
 
 
368 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  23.69 
 
 
313 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  36.92 
 
 
362 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2289  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
359 aa  43.9  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345103  hitchhiker  0.00338003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  23.85 
 
 
317 aa  43.5  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  22.06 
 
 
370 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14121  Fatty acid desaturase, type 2  33.33 
 
 
361 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>