48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_25769 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  100 
 
 		 436 aa  904    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  39.75 
 
 		 495 aa  265  8.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  40.96 
 
 		 387 aa  262  6.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  36.97 
 
 		 375 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  40.27 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  36.62 
 
 		 405 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  35.51 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  34.99 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  36.88 
 
 		 405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  38.7 
 
 		 471 aa  233  7.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  35.62 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  35.61 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  34.45 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  38.4 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  36.65 
 
 		 381 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  31.59 
 
 		 435 aa  206  5e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  31.75 
 
 		 418 aa  206  9e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  33.59 
 
 		 359 aa  186  8e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  30.93 
 
 		 359 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  32.74 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  31.01 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  40.22 
 
 		 180 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06461  hypothetical protein  44.26 
 
 		 141 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  27.09 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  23.83 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  24.87 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  23.59 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  26.89 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  25.96 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  23.86 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  26.69 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  28.87 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  30.21 
 
 		 349 aa  52.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  30.61 
 
 		 357 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  31.11 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  28.74 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  26.67 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  31.11 
 
 		 352 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  31.4 
 
 		 349 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  30.85 
 
 		 358 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  24.35 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  28.81 
 
 		 358 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  37.25 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  31.71 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  27.78 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  28 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  21.93 
 
 		 393 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  21.1 
 
 		 424 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>