94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0888 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  100 
 
 		 393 aa  802    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  84.44 
 
 		 380 aa  628  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  61.71 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  61.71 
 
 		 426 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  61.71 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  64.43 
 
 		 364 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  61.71 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  61.43 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  61.43 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  62.64 
 
 		 349 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  60.74 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  57.66 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  65.85 
 
 		 313 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  57.19 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  31.74 
 
 		 374 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  31.74 
 
 		 374 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  25.59 
 
 		 349 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  27.8 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  26.21 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  26.86 
 
 		 352 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  26.51 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  28.47 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  24.4 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  30.62 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  29.79 
 
 		 349 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  29.32 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  26.52 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  21.99 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  25.87 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  27.67 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  26.8 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  25.41 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  26.98 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  27.56 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  24.12 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  27.67 
 
 		 362 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  26.05 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  26.32 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  31.09 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  25.84 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  25.84 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  25.84 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  25.45 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  25.84 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  25.84 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  25.84 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  25.9 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  40.24 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  20.39 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  26.51 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  25.5 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  24.76 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  25.86 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  40.4 
 
 		 358 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  22.63 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  31.31 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  31.63 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  33.98 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  30.61 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  30.61 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  30.61 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  30.61 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  30.61 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  30.61 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  30.61 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  30.61 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  33.33 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  30.48 
 
 		 368 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  27.8 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  29.52 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  38.24 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  31.94 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  25.39 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  29.52 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  33.33 
 
 		 360 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  34.62 
 
 		 364 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  31.33 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  22.93 
 
 		 335 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  23.42 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  24.12 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  33.8 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  23.62 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  35.63 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  21.93 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  22.22 
 
 		 388 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  24.49 
 
 		 372 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  30.47 
 
 		 356 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  27.55 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  24.05 
 
 		 448 aa  43.1  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  31.36 
 
 		 362 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2289  fatty acid desaturase  31.33 
 
 		 359 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345103  hitchhiker  0.00338003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>