63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81126 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  100 
 
 
435 aa  909    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  59.67 
 
 
418 aa  536  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  52.07 
 
 
471 aa  429  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  46.08 
 
 
448 aa  354  2e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  42.02 
 
 
394 aa  272  9e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  31.59 
 
 
436 aa  206  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  33.51 
 
 
387 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  35.16 
 
 
405 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  33.78 
 
 
495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  34.89 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  34.13 
 
 
359 aa  197  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  31.95 
 
 
359 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  33.15 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  32.71 
 
 
375 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  30.46 
 
 
391 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  31.01 
 
 
360 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  31.35 
 
 
388 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  30.39 
 
 
357 aa  169  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  33.24 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  30.79 
 
 
380 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  29.35 
 
 
381 aa  154  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  38.46 
 
 
180 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  28.15 
 
 
435 aa  99.8  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  24.59 
 
 
352 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  24.38 
 
 
352 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06461  hypothetical protein  36.07 
 
 
141 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  23.97 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  22.56 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  22.38 
 
 
349 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  22.38 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  23.68 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  23.68 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  23.78 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  25.47 
 
 
357 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  22.85 
 
 
454 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  23.61 
 
 
376 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  27.04 
 
 
286 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  20.75 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  20.75 
 
 
424 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  38.96 
 
 
356 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  20.75 
 
 
424 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  20.75 
 
 
426 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  20.75 
 
 
424 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  20.75 
 
 
424 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  21.09 
 
 
313 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  25.83 
 
 
350 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  22.11 
 
 
346 aa  55.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  44.44 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  44.44 
 
 
358 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  35.06 
 
 
354 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  20.76 
 
 
344 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  31.18 
 
 
349 aa  51.2  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  35.62 
 
 
374 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  26.88 
 
 
376 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  26.09 
 
 
328 aa  50.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  34.72 
 
 
351 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  32.79 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  32.79 
 
 
352 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  24.81 
 
 
368 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
349 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  27.35 
 
 
349 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  28.57 
 
 
368 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  22.79 
 
 
330 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>