73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2718 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  97.42 
 
 
424 aa  780    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  97.42 
 
 
424 aa  780    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  97.65 
 
 
424 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  90.68 
 
 
454 aa  729    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  99.75 
 
 
410 aa  772    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  97.42 
 
 
424 aa  780    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  100 
 
 
426 aa  863    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  99.68 
 
 
313 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  60.86 
 
 
380 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  61.71 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  62.54 
 
 
346 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  62.35 
 
 
344 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  57.76 
 
 
349 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  60.23 
 
 
364 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  32.88 
 
 
374 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  32.88 
 
 
374 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  28.75 
 
 
352 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  28.75 
 
 
352 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  29.65 
 
 
349 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  24.53 
 
 
351 aa  93.6  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  27.4 
 
 
359 aa  87.8  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  27.04 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  25.47 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  26.18 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  23.45 
 
 
359 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  26.98 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  27.03 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  22.67 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  26.81 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  26.64 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  25.42 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  29.72 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  26.58 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  25.08 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  24.38 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  24.92 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  24.92 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  26.56 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  24.75 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  27.12 
 
 
354 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  25.8 
 
 
357 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  26.27 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  26.88 
 
 
348 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  24.08 
 
 
343 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  25.98 
 
 
350 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  27.34 
 
 
319 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  27.34 
 
 
319 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  27.34 
 
 
319 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  43.53 
 
 
328 aa  60.1  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  35.61 
 
 
358 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  21.09 
 
 
435 aa  57.8  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  25.14 
 
 
348 aa  57  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  34.85 
 
 
358 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  42.03 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  32.54 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  26.09 
 
 
352 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  25.65 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  35.14 
 
 
378 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  21.75 
 
 
471 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  21.62 
 
 
418 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  24.14 
 
 
448 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  23.16 
 
 
495 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  33.81 
 
 
364 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  22.67 
 
 
435 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  30.48 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  21.93 
 
 
335 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2289  fatty acid desaturase  33.66 
 
 
359 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345103  hitchhiker  0.00338003 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  33.12 
 
 
364 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  34 
 
 
362 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  25 
 
 
345 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  40.74 
 
 
286 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  38.18 
 
 
379 aa  43.1  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  21 
 
 
317 aa  43.1  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>