82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3596 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  100 
 
 		 364 aa  733    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  69.25 
 
 		 349 aa  491  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  66.11 
 
 		 380 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  64.43 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  59.65 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  60.37 
 
 		 344 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  60.23 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  60.23 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  60.23 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  60.23 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  60.23 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  59.94 
 
 		 410 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  60.51 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  65.97 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  31.72 
 
 		 374 aa  176  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  31.72 
 
 		 374 aa  176  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  24.93 
 
 		 352 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  24.93 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  25.33 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  24.2 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  27.33 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  28.46 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  25.19 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  24.22 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  28.02 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  25.09 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  28.67 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  28.53 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  28.33 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  24.22 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  24.5 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  27.95 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  24.2 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  29.03 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  27.56 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  27.95 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  26.46 
 
 		 357 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  22.34 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  25.84 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  26.69 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  24.27 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  25.16 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  24.51 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  24.51 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  23.95 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  26.38 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  26.38 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  26.38 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  24.12 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  24.1 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  27.76 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  23.9 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  22.38 
 
 		 495 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  25 
 
 		 317 aa  54.7  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  23.81 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  31.15 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  33.06 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  29.9 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  26.56 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  29.66 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  33.78 
 
 		 378 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  23.72 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  21.82 
 
 		 471 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  24.41 
 
 		 325 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  38.57 
 
 		 286 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  19.43 
 
 		 335 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  22.22 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  32.94 
 
 		 379 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2289  fatty acid desaturase  30.28 
 
 		 359 aa  46.6  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345103  hitchhiker  0.00338003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  25.78 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  30.88 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  35.14 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  30.34 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  27.22 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  31.76 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  30.59 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  27.17 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  28.72 
 
 		 365 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  30.21 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  28.14 
 
 		 357 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  36.05 
 
 		 426 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>