69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02750 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  100 
 
 
448 aa  932    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  46.08 
 
 
435 aa  354  2e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  46.48 
 
 
418 aa  352  5.9999999999999994e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  45.35 
 
 
471 aa  352  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  39.9 
 
 
394 aa  258  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  37.21 
 
 
362 aa  219  7.999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  34.45 
 
 
436 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  37.03 
 
 
387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  33.75 
 
 
359 aa  207  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  35.44 
 
 
495 aa  206  8e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  32.08 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  30.15 
 
 
360 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  31.66 
 
 
375 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  34.04 
 
 
405 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  34.04 
 
 
405 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  32.82 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  34.44 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  33.59 
 
 
381 aa  182  7e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  32.13 
 
 
391 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  31.73 
 
 
357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  34.98 
 
 
380 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  32.31 
 
 
180 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  27.93 
 
 
435 aa  89.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  25 
 
 
352 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  24.87 
 
 
352 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06461  hypothetical protein  36.59 
 
 
141 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  24.37 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  24.58 
 
 
350 aa  77  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  22.49 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  23.65 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  23.65 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  23.1 
 
 
351 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  28.12 
 
 
376 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  24.34 
 
 
376 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  23.42 
 
 
358 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  26.52 
 
 
286 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  22.49 
 
 
344 aa  59.7  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  23.49 
 
 
356 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  22.49 
 
 
346 aa  57.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  22.99 
 
 
357 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  22.64 
 
 
358 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  23.36 
 
 
374 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  22.46 
 
 
376 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  23.87 
 
 
349 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  23.03 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  23.56 
 
 
349 aa  50.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  24.14 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  22.51 
 
 
349 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  23.24 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  24.14 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  24.14 
 
 
426 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  24.14 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  24.14 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  24.14 
 
 
410 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  24.14 
 
 
313 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  22.71 
 
 
352 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  23.43 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  26.43 
 
 
328 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  23.75 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  27.38 
 
 
343 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  23.39 
 
 
343 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  22.82 
 
 
343 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  23.6 
 
 
343 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  28.57 
 
 
343 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  23.6 
 
 
319 aa  43.1  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  24.05 
 
 
393 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  22.93 
 
 
343 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  23.6 
 
 
319 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  23.6 
 
 
319 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>