57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_72518 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  100 
 
 		 418 aa  871    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  59.67 
 
 		 435 aa  536  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  54.41 
 
 		 471 aa  433  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  46.48 
 
 		 448 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  42.7 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  35.71 
 
 		 387 aa  213  7e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  34.05 
 
 		 362 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  34.77 
 
 		 359 aa  207  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  31.75 
 
 		 436 aa  206  8e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  32.11 
 
 		 359 aa  200  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  31.54 
 
 		 495 aa  199  7e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  33.7 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  33.7 
 
 		 405 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  33.43 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  32.07 
 
 		 388 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  30.83 
 
 		 360 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  31.58 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  31.88 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  30.03 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  31.94 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  30.56 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  26.84 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  25.93 
 
 		 352 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  25.93 
 
 		 352 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  25.49 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  25.07 
 
 		 350 aa  93.2  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06461  hypothetical protein  35.07 
 
 		 141 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  38.4 
 
 		 180 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  24.58 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  25.07 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  22.31 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  25.09 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  31.45 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  24.13 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  22.82 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  23.57 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  24.83 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  23.08 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  23.08 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  25.84 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  21.21 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  25.68 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  24.91 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  34.92 
 
 		 356 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  23.89 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  20.82 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  20.88 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  20.88 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  20.88 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  20.88 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  20.6 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  24.91 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  21.62 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  24.23 
 
 		 354 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  22.45 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  33.33 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  24.84 
 
 		 328 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>