31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_06461 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_06461  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  290  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  75.19 
 
 
380 aa  213  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  72.44 
 
 
375 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  71.09 
 
 
405 aa  201  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  68.5 
 
 
391 aa  201  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  64.19 
 
 
405 aa  201  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  67.72 
 
 
388 aa  197  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  59.02 
 
 
362 aa  165  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  55.91 
 
 
387 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  54.07 
 
 
495 aa  155  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  71.43 
 
 
344 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  44 
 
 
381 aa  130  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  44.26 
 
 
436 aa  110  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  35.07 
 
 
418 aa  92.4  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  42.48 
 
 
359 aa  90.9  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  39.82 
 
 
360 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  42.48 
 
 
357 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  42.48 
 
 
359 aa  88.6  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  36.07 
 
 
435 aa  87.4  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  40.98 
 
 
471 aa  82.8  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  36.59 
 
 
448 aa  82  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  38.4 
 
 
394 aa  72  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  37.63 
 
 
435 aa  61.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  30.85 
 
 
376 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  31.11 
 
 
376 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  29.7 
 
 
352 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  26.8 
 
 
351 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  27.17 
 
 
349 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  27.66 
 
 
350 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  31 
 
 
352 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  24.74 
 
 
352 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>