106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4492 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  100 
 
 
357 aa  738    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  68.08 
 
 
359 aa  511  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  65.52 
 
 
359 aa  491  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  67.14 
 
 
360 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  32.65 
 
 
448 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  31 
 
 
471 aa  185  9e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  31.03 
 
 
435 aa  169  8e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  31.52 
 
 
436 aa  168  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  30.85 
 
 
418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  32.51 
 
 
394 aa  166  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  32.09 
 
 
362 aa  159  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  30.89 
 
 
375 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  31.27 
 
 
387 aa  159  7e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  33.06 
 
 
405 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  33.33 
 
 
405 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  31.42 
 
 
495 aa  155  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  32.04 
 
 
380 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  31.79 
 
 
388 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  31.61 
 
 
391 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  31.01 
 
 
349 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  29.21 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  29.34 
 
 
352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  27.75 
 
 
350 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  27.83 
 
 
352 aa  139  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  31.29 
 
 
344 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  29.66 
 
 
376 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  28 
 
 
351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  28.93 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  28.97 
 
 
435 aa  116  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  33.97 
 
 
286 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  27.12 
 
 
346 aa  92.4  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  27.89 
 
 
344 aa  89.4  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06461  hypothetical protein  42.48 
 
 
141 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  26.63 
 
 
376 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
374 aa  86.3  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
374 aa  86.3  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  23.78 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  30.8 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  26.29 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  26.67 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  26.1 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  23.76 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  26.1 
 
 
424 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  26.1 
 
 
424 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  26.1 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  26.1 
 
 
424 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  28.69 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  27.54 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  23.4 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  24.56 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  26.59 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  26.19 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  25.79 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  26.19 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  25.79 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  25.79 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  26.19 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  25.79 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  29.46 
 
 
180 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  25.79 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  27.73 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  25.61 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  26.25 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  28.4 
 
 
357 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  27.78 
 
 
349 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  25.51 
 
 
374 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  23 
 
 
358 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  26.83 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  23.08 
 
 
354 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  25.71 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  24.14 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  27.12 
 
 
352 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  23.03 
 
 
360 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  23.11 
 
 
328 aa  56.2  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  26.69 
 
 
353 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  23.42 
 
 
358 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  23.88 
 
 
368 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  23.61 
 
 
330 aa  52.8  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  24.14 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  27 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  23.97 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  24.26 
 
 
368 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  23.17 
 
 
361 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  23.49 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  23.49 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  23.17 
 
 
361 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  23.17 
 
 
361 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  23.17 
 
 
361 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  23.17 
 
 
361 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  23.17 
 
 
361 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  29.82 
 
 
362 aa  49.7  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  22.86 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  22.55 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  23.34 
 
 
372 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  21.2 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  22.86 
 
 
361 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  24.22 
 
 
313 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  26.95 
 
 
317 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  22.3 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  22.18 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>