54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2577 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  100 
 
 		 371 aa  759    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  28.16 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  26.86 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  27.8 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  26.96 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  30.65 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  29.46 
 
 		 293 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  29.56 
 
 		 309 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  28.79 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  29.18 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  29.08 
 
 		 685 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  28 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 325 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  26.56 
 
 		 343 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  26.56 
 
 		 343 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  28.24 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  29.29 
 
 		 299 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  29.62 
 
 		 349 aa  92.8  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  29.78 
 
 		 277 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  28.57 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  31.61 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  24.6 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  25.78 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  34.04 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  26.55 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  26.47 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  24.77 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  35.04 
 
 		 311 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  21.41 
 
 		 359 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  23.53 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  20.41 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  22.11 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  23.53 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  23.53 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  23.53 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  23.53 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  23.53 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  24.91 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  23.05 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  23.46 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  23.85 
 
 		 353 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  23.87 
 
 		 343 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  24.51 
 
 		 330 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  25.87 
 
 		 354 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  26.25 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  24.22 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  22.75 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  22.55 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  22.87 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  31.94 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  35.8 
 
 		 455 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  23.25 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  20.91 
 
 		 360 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3898  fatty acid desaturase  22.4 
 
 		 349 aa  42.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>