93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7514 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  100 
 
 		 311 aa  626  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  38.7 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  35.79 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  35.81 
 
 		 336 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  33.56 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  35.92 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  34.86 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  34.51 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  34.51 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  34.15 
 
 		 378 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  34.15 
 
 		 340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  31.64 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  29.9 
 
 		 363 aa  105  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  29.76 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  30.47 
 
 		 363 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.92 
 
 		 765 aa  95.5  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  29.39 
 
 		 362 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  28.52 
 
 		 362 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  25.67 
 
 		 475 aa  93.6  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  29.58 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  26.84 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  26.74 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  23.17 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  28.75 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  27.39 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  28.79 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  30.8 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  25.45 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  26.91 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  25.76 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  26.55 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  29.05 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  29.05 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  29.05 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  29.05 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  29.05 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  28.63 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  25 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  29.05 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  24.23 
 
 		 685 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  26.26 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  25.23 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  24.36 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  24.22 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  27.38 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  29.35 
 
 		 486 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  36.36 
 
 		 370 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  25.84 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  27.19 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  27.3 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  27.19 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  27.19 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  27.19 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  36.84 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1495  Fatty acid desaturase  25.76 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  23.81 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  34.68 
 
 		 383 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  27.16 
 
 		 540 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  27.4 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  32.1 
 
 		 343 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  32.1 
 
 		 343 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  25.17 
 
 		 489 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  34.67 
 
 		 349 aa  49.3  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  22.4 
 
 		 341 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  32.14 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2059  hypothetical protein  21.46 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.383328  normal  0.370855 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5636  fatty acid desaturase  38.81 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  33.33 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  32 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6001  fatty acid desaturase  38.81 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6492  fatty acid desaturase  38.81 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  31.58 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  27.84 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  31.58 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  30.89 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1073  fatty acid desaturase  27.03 
 
 		 362 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000383129  normal  0.912357 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  25.22 
 
 		 517 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  22.66 
 
 		 356 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3898  fatty acid desaturase  21.36 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  24.78 
 
 		 463 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  34.15 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0156  fatty acid desaturase  22.71 
 
 		 358 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  24.8 
 
 		 429 aa  45.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  25.16 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  27.8 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2063  Fatty acid desaturase  29.68 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  25 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  23.57 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_003296  RS02366  putative transmembrane acyl-COA desaturase (fatty acid desaturase) oxidoreductase protein  26.24 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0749638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  21.24 
 
 		 349 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  27.67 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  32.18 
 
 		 358 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>