30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1008 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  100 
 
 		 325 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  68.97 
 
 		 291 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  62.37 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  66.09 
 
 		 291 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  64.29 
 
 		 298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  66.09 
 
 		 291 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  60.49 
 
 		 331 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  65.23 
 
 		 293 aa  391  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  59.03 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  56.57 
 
 		 346 aa  341  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  55.96 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  53.07 
 
 		 341 aa  335  9e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  56.84 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  56.84 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  59.83 
 
 		 277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  59.07 
 
 		 266 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  54.07 
 
 		 299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  59.43 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  29.11 
 
 		 685 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  31.17 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  26.45 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  26.72 
 
 		 353 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  24.6 
 
 		 345 aa  46.2  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2048  Fatty acid desaturase  27.92 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  23.05 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  28.18 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  24.07 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  21.74 
 
 		 359 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  23.48 
 
 		 318 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>