55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2925 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  100 
 
 
291 aa  593  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  75.43 
 
 
291 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  75.09 
 
 
298 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  75.43 
 
 
291 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  68.97 
 
 
325 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  69.75 
 
 
306 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  67.35 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  66.67 
 
 
293 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  58.45 
 
 
349 aa  347  9e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  57.75 
 
 
370 aa  347  1e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  58.33 
 
 
346 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  56.54 
 
 
341 aa  338  7e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  59.79 
 
 
343 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  59.79 
 
 
343 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  64.1 
 
 
299 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  63.2 
 
 
266 aa  316  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  61.8 
 
 
277 aa  315  7e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  62.14 
 
 
241 aa  285  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  31.94 
 
 
685 aa  109  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  29.18 
 
 
371 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  34 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  26.75 
 
 
353 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  27.17 
 
 
342 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  27.57 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  27.57 
 
 
333 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  27.57 
 
 
333 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  27.57 
 
 
333 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  27.57 
 
 
333 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  27.57 
 
 
343 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  27.1 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  27.68 
 
 
352 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3888  Fatty acid desaturase  28.27 
 
 
258 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  23.01 
 
 
330 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  27.23 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  23.76 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  24.46 
 
 
368 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  31.58 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  28.05 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  22.22 
 
 
349 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  26.36 
 
 
345 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  23.91 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  25.35 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  28.3 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  23.2 
 
 
378 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  24.16 
 
 
359 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  27.46 
 
 
358 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  27.73 
 
 
320 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  28.08 
 
 
387 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  23.89 
 
 
352 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  25 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  25 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  25 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  25 
 
 
343 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  23.32 
 
 
330 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5230  fatty acid desaturase  26.63 
 
 
286 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>