18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3888 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3888  Fatty acid desaturase  100 
 
 		 258 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2048  Fatty acid desaturase  58.43 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5230  fatty acid desaturase  52.7 
 
 		 286 aa  274  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0972  beta-carotene ketolase  36.14 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0162897  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  28.27 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  27.6 
 
 		 346 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5106  fatty acid desaturase  23.66 
 
 		 318 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.504058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  26.26 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  26.26 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  48.48 
 
 		 429 aa  46.6  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  25.91 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  22.73 
 
 		 327 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  26.14 
 
 		 353 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  25.45 
 
 		 345 aa  45.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  26.7 
 
 		 293 aa  45.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  26.53 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  27.27 
 
 		 349 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  25.22 
 
 		 321 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>