80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7780 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  100 
 
 		 353 aa  727    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  38.94 
 
 		 330 aa  215  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  36.62 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  36.79 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  32.52 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  29.96 
 
 		 339 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  28.47 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3477  fatty acid desaturase  24.27 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  26.88 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  26.6 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  26.27 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  29.28 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  26.77 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  26.27 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  26.27 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  25.38 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  26.27 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  26.27 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  28.02 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  26.27 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  26.27 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  27.76 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  28.81 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  27.95 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  27.11 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  25.39 
 
 		 540 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  25.7 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  27.17 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  25.39 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  27.95 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  25.39 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  25.39 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  25.39 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  24.85 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  27.11 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  26.18 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  28.51 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  27.57 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  26.75 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  24.84 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  24.84 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  24.43 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  25.78 
 
 		 293 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  25.32 
 
 		 685 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  26.22 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  24.03 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  24.03 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  23.44 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  23.62 
 
 		 325 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  23.25 
 
 		 341 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  24.25 
 
 		 311 aa  53.1  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  24.16 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  26.04 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  26.3 
 
 		 489 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  28.81 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  34.48 
 
 		 113 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  25.33 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  23.56 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  26.72 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  25.35 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  26.52 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  24 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4357  fatty acid desaturase  35.29 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  23.85 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  26.67 
 
 		 545 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4765  fatty acid desaturase  26.69 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  25.93 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  24.82 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3888  Fatty acid desaturase  26.14 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  25.46 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  26.72 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  22.4 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  25.87 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  24.26 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  23.56 
 
 		 266 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  32.93 
 
 		 427 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  23 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  27.69 
 
 		 573 aa  42.7  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  23.91 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1682  hypothetical protein  48.72 
 
 		 119 aa  42.7  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894508  normal  0.497271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>