29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4765 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4765  fatty acid desaturase  100 
 
 
331 aa  648    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  36.93 
 
 
317 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  30.77 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  30.77 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  30.77 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  30.77 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  30.77 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  30.77 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  30.77 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  28.21 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  28.26 
 
 
307 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  25.3 
 
 
311 aa  53.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  26 
 
 
339 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  27.78 
 
 
330 aa  52.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  27.1 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  26.71 
 
 
353 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  27.92 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  24.16 
 
 
329 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  24.66 
 
 
540 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  25.19 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  22.35 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  24.66 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  24.66 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  24.66 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  24.66 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  24.66 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  27.89 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  25.98 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  24.34 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>