54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0361 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  100 
 
 		 330 aa  664    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  58.2 
 
 		 321 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  54.6 
 
 		 307 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  56.66 
 
 		 320 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  52.92 
 
 		 339 aa  308  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  46.76 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  40.79 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  40.95 
 
 		 329 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  39.08 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  39.88 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  39.58 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  39.58 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  39.58 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  39.58 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  39.82 
 
 		 540 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  35.69 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  35.06 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  29.11 
 
 		 338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  27.94 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  33.89 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  33.89 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  33.89 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  33.89 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  33.89 
 
 		 333 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  33.89 
 
 		 333 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  33.89 
 
 		 343 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  25.79 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  31.67 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  29.71 
 
 		 486 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  31.53 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  29.41 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  26.67 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  27.72 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  29.37 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  26.51 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  28.07 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  27.5 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  28.02 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  24.38 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  26.42 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  24.84 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  26.69 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  39.47 
 
 		 113 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  32 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  28.09 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  31.87 
 
 		 427 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  26.07 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0268  Fatty acid desaturase  31.78 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4765  fatty acid desaturase  36 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  33.33 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  33.33 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  23.08 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3477  fatty acid desaturase  23.31 
 
 		 377 aa  42.7  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  22.07 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>