57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2554 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  100 
 
 		 338 aa  685    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  32.5 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  30.71 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  31.4 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  29.11 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  31.39 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  31.4 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  34.05 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  33.77 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  33.77 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  33.77 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  33.77 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  33.77 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  33.77 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  33.77 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  31.79 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  32.97 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  31.25 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  31.25 
 
 		 540 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  31.25 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  31.25 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  31.25 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  31.25 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  30.39 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  33.2 
 
 		 486 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  27.98 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  21.53 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  28.52 
 
 		 489 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  27.65 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  27.5 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  28.2 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  26.89 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  26.6 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  27.24 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  27 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  28.37 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  25.72 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  26.83 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  27.16 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  34.62 
 
 		 113 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  23.87 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  25.44 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  25.66 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  24.02 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3477  fatty acid desaturase  30.86 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  24.44 
 
 		 360 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0268  Fatty acid desaturase  32.82 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  31.74 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  27.2 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  31.03 
 
 		 475 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  23.15 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6492  fatty acid desaturase  26.32 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6001  fatty acid desaturase  26.32 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5636  fatty acid desaturase  26.32 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4765  fatty acid desaturase  28.24 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  26.59 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  27 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>