23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0620 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  233  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  41.98 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  34.21 
 
 		 321 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  34.21 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  39.47 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  37.66 
 
 		 313 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  32.1 
 
 		 339 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  34.62 
 
 		 338 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  29.27 
 
 		 330 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  34.48 
 
 		 353 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  33.73 
 
 		 314 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  35.06 
 
 		 314 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  31.37 
 
 		 318 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  32.93 
 
 		 378 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  33.33 
 
 		 315 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  33.33 
 
 		 315 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  33.78 
 
 		 350 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  27.16 
 
 		 463 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1682  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894508  normal  0.497271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  28.95 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  31.03 
 
 		 311 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  33.85 
 
 		 339 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  27.16 
 
 		 489 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>