48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7418 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  100 
 
 
318 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  49.08 
 
 
314 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  44.23 
 
 
313 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  43.61 
 
 
314 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  29.75 
 
 
330 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  24.18 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  28.47 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  32.11 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  29.46 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  28.89 
 
 
329 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  28.57 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  28.57 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  28.57 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  28.57 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  28.25 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  25.87 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  25.87 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  25.87 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  25.87 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  25.87 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  25.87 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  25.87 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  28.25 
 
 
540 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  27.16 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  27.5 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  26.4 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  27.94 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  28.37 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  24.73 
 
 
378 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  27.15 
 
 
339 aa  62.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  26.79 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  26.27 
 
 
315 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  27.39 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  27.47 
 
 
486 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  26.52 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1682  hypothetical protein  47.69 
 
 
119 aa  54.3  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894508  normal  0.497271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  28.57 
 
 
489 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  22.36 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  23.67 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  23.59 
 
 
324 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  24.62 
 
 
463 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  26.17 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  31.37 
 
 
113 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  22.97 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  22.94 
 
 
291 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  22.94 
 
 
291 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  24.43 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  22.38 
 
 
341 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>