13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1682 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1682  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  231  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894508  normal  0.497271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  50 
 
 		 314 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  43.43 
 
 		 313 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  42.67 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  39 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  47.69 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  35.71 
 
 		 350 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  37.68 
 
 		 307 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  38.89 
 
 		 378 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  27.78 
 
 		 336 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  32.91 
 
 		 338 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  48.72 
 
 		 353 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  35 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>