69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2818 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  100 
 
 		 463 aa  930    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  59.74 
 
 		 489 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  60.3 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 338 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  29.72 
 
 		 330 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  27.95 
 
 		 311 aa  82.8  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  25.55 
 
 		 339 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  29.52 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  28.85 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  29.78 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  29.78 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  29.78 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  29.78 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  29.52 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  29.78 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  29.49 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  22.34 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  27.99 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  27.99 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  27.99 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  27.99 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  27.99 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  28.1 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  28.96 
 
 		 315 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  29.34 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  25.95 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  27.99 
 
 		 540 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  26.46 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  25.77 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  26.69 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  27.27 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  28.02 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  26.92 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  24.19 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  25 
 
 		 314 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  24.07 
 
 		 359 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2666  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.43 
 
 		 202 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000403275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  25.3 
 
 		 330 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  29.1 
 
 		 304 aa  54.3  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4419  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.74 
 
 		 217 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  26.54 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  26.33 
 
 		 353 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  24.78 
 
 		 314 aa  50.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3658  putative dual specificity phosphatase  30.87 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  25.68 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  26.06 
 
 		 317 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4138  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.88 
 
 		 217 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2238  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.09 
 
 		 242 aa  49.7  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  27.95 
 
 		 328 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4862  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.45 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  22.09 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  31.43 
 
 		 313 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4706  PAP2 family protein  25.64 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0195137  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2865  hypothetical protein  26.88 
 
 		 206 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.423571 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5104  PAP2 family protein  25.64 
 
 		 215 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5133  PAP2 family protein  25.64 
 
 		 215 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000713606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5140  PAP2 family protein  25.64 
 
 		 215 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000194372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0102  PAP2 family protein  25.64 
 
 		 215 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000373231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  31.68 
 
 		 360 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5138  PAP2 family protein  24.79 
 
 		 215 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000319321  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  27.04 
 
 		 387 aa  44.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4866  PAP2 family protein  25.64 
 
 		 215 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3589  putative PAP2 family protein  25.51 
 
 		 219 aa  44.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000468424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5238  PAP2 family protein  25.64 
 
 		 215 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.108629  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  25.23 
 
 		 341 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0008  dual specificity protein phosphatase  30.89 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.851139  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4721  PAP2 family protein  25.51 
 
 		 215 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00298694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3303  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.67 
 
 		 242 aa  43.5  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.306243  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  36.27 
 
 		 449 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>