97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1834 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  100 
 
 		 321 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  83.75 
 
 		 320 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  58.68 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  52.87 
 
 		 307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  48.97 
 
 		 343 aa  298  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  50.81 
 
 		 339 aa  296  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  39.32 
 
 		 329 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  38.75 
 
 		 339 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  39.94 
 
 		 328 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  39.94 
 
 		 328 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  39.94 
 
 		 328 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  39.94 
 
 		 328 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  39.63 
 
 		 328 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  39.94 
 
 		 540 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  37.33 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  32.69 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  32.65 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  31.39 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  30.86 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  30.86 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  30.86 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  30.86 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  30.86 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  30.86 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  30.86 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  26.74 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  30.34 
 
 		 383 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  28.23 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  30.12 
 
 		 314 aa  85.9  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  29.84 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  26.77 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  26.89 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  23.99 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  27.76 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  27.16 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  27.42 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  29.28 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  29.46 
 
 		 489 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  27.84 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  25.51 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  25.25 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  25.4 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  26.17 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  34.21 
 
 		 113 aa  57  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  25.9 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  23.53 
 
 		 317 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_003296  RS02366  putative transmembrane acyl-COA desaturase (fatty acid desaturase) oxidoreductase protein  42.11 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0749638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  24.26 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  21.96 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  25.78 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.89 
 
 		 765 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  26.55 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  26.24 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  25.86 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  25.41 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  26.24 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  25.86 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  26.24 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  25.41 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  26.24 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  26.24 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  23.9 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  28.05 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  25.41 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  23.27 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  26.24 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  24.7 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  24.28 
 
 		 475 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  26.09 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  25.51 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0268  Fatty acid desaturase  22.91 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  31.63 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  31.63 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  26.09 
 
 		 355 aa  46.6  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  25.29 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  23.23 
 
 		 344 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1804  Fatty acid desaturase  24.83 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  22.4 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  25 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  26.62 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  22.87 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  24.39 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  24.43 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  24.77 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  24.58 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  23.35 
 
 		 362 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1829  fatty acid desaturase  24.9 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2048  Fatty acid desaturase  22.22 
 
 		 254 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  28.4 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22677  dihydroderamide delta-4 desaturase  25.09 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404878  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  28.4 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  26.8 
 
 		 495 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  25.2 
 
 		 372 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  24.53 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  30.56 
 
 		 380 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  24.55 
 
 		 405 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>