31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0284 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  100 
 
 
387 aa  796    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  70.55 
 
 
345 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  45.96 
 
 
327 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4982  fatty acid desaturase  45.69 
 
 
343 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653889 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  37.05 
 
 
429 aa  202  9e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22677  dihydroderamide delta-4 desaturase  34.38 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404878  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04405  sphingolipid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06940)  33.52 
 
 
418 aa  176  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54788  fatty acid desaturase (DSD1)  35.06 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.282739 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  28.81 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  29.08 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  29.08 
 
 
343 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  29.08 
 
 
309 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  27.2 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  29.08 
 
 
333 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  29.08 
 
 
333 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  29.08 
 
 
333 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  29.08 
 
 
333 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  32.08 
 
 
348 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3079  fatty acid desaturase  26.61 
 
 
332 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  31.74 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  26.34 
 
 
313 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1495  Fatty acid desaturase  25.21 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  24.34 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  28.08 
 
 
291 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  24.89 
 
 
370 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  25.49 
 
 
380 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  25.11 
 
 
356 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  26.19 
 
 
374 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  25.1 
 
 
357 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  27.24 
 
 
489 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>