11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54788 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_54788  fatty acid desaturase (DSD1)  100 
 
 
371 aa  775    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.282739 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04405  sphingolipid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06940)  54.99 
 
 
418 aa  355  5e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  45.68 
 
 
429 aa  310  2e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22677  dihydroderamide delta-4 desaturase  37.92 
 
 
321 aa  218  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4982  fatty acid desaturase  37.71 
 
 
343 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  36.99 
 
 
345 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  38.07 
 
 
327 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  35.06 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46383  predicted protein  34.82 
 
 
454 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.372126  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4517  fatty acid desaturase, putative  33.33 
 
 
316 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.61204  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  23.83 
 
 
489 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>