34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06240 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  100 
 
 
429 aa  887    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04405  sphingolipid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06940)  49.88 
 
 
418 aa  338  8e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54788  fatty acid desaturase (DSD1)  45.68 
 
 
371 aa  311  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.282739 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22677  dihydroderamide delta-4 desaturase  39.32 
 
 
321 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  35.57 
 
 
387 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  38.51 
 
 
345 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  35.93 
 
 
327 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4982  fatty acid desaturase  37.76 
 
 
343 aa  199  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653889 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  26.83 
 
 
341 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46383  predicted protein  32.69 
 
 
454 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.372126  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  25.41 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  26.48 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  26.48 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  24.2 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  26.13 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3079  fatty acid desaturase  61.29 
 
 
332 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  23.74 
 
 
372 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  23.68 
 
 
360 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  23.68 
 
 
360 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3888  Fatty acid desaturase  48.48 
 
 
258 aa  46.6  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  23.68 
 
 
360 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1495  Fatty acid desaturase  45 
 
 
346 aa  46.6  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2048  Fatty acid desaturase  51.61 
 
 
254 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4769  fatty acid desaturase  45.45 
 
 
305 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.237988  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  23.66 
 
 
424 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  25.68 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  24.53 
 
 
372 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  25.78 
 
 
340 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  26.85 
 
 
362 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  24.11 
 
 
346 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  24.11 
 
 
346 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  25.79 
 
 
363 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  31.62 
 
 
339 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.8 
 
 
765 aa  43.1  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>