61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2886 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  100 
 
 
372 aa  758    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  79.13 
 
 
372 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  68.01 
 
 
360 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  66.02 
 
 
361 aa  511  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  66.2 
 
 
361 aa  510  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  65.74 
 
 
361 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  66.76 
 
 
361 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  66.76 
 
 
361 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  67.05 
 
 
361 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  67.05 
 
 
361 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  67.05 
 
 
361 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  67.34 
 
 
361 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  67.05 
 
 
361 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1073  fatty acid desaturase  43.98 
 
 
362 aa  272  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000383129  normal  0.912357 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2289  fatty acid desaturase  45.54 
 
 
359 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345103  hitchhiker  0.00338003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  31.71 
 
 
362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1829  fatty acid desaturase  32.63 
 
 
349 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  25 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  27.38 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  24.44 
 
 
360 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  25.91 
 
 
469 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
356 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.4 
 
 
765 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  24.41 
 
 
321 aa  54.3  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  23.58 
 
 
373 aa  54.3  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  22.98 
 
 
427 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  23.25 
 
 
475 aa  53.1  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  21.89 
 
 
517 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  21.94 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  21.94 
 
 
360 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  21.94 
 
 
360 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  25 
 
 
362 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  24.68 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  22.37 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  22.26 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  25.15 
 
 
455 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  21.94 
 
 
378 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  21.27 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  23.48 
 
 
362 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  24.36 
 
 
363 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  25.53 
 
 
358 aa  46.6  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  21.66 
 
 
365 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  25.1 
 
 
330 aa  46.6  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  24.46 
 
 
346 aa  46.2  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  25.64 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  23.25 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  29.7 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  23.71 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  23.88 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  26.86 
 
 
540 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  21.93 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  30.83 
 
 
381 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  23.57 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  24.35 
 
 
371 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  28.33 
 
 
453 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  24.34 
 
 
363 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  24.53 
 
 
429 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  29.33 
 
 
366 aa  43.5  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  21.64 
 
 
368 aa  42.7  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  26.84 
 
 
328 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>