67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6010 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  89.33 
 
 
378 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  93.33 
 
 
360 aa  691    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  93.06 
 
 
360 aa  689    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  91.76 
 
 
340 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  93.06 
 
 
360 aa  689    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  100 
 
 
360 aa  740    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  65.1 
 
 
358 aa  454  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  59.59 
 
 
363 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  51.57 
 
 
362 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  51.3 
 
 
362 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  52.01 
 
 
363 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  50.57 
 
 
362 aa  339  4e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.11 
 
 
765 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  47.59 
 
 
344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  39.82 
 
 
475 aa  263  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  37.91 
 
 
330 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  35.92 
 
 
311 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  32 
 
 
324 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  32.12 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  33.04 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  28.94 
 
 
309 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  30.06 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  26.83 
 
 
339 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  30 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  30.36 
 
 
540 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  29.22 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  30.28 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  30.28 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  30.28 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  30.28 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  25.24 
 
 
361 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  26.74 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  24.29 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  26.48 
 
 
315 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  26.45 
 
 
315 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  24.54 
 
 
313 aa  52.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5527  hypothetical protein  25.68 
 
 
293 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  25.18 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  26.58 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  26.58 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  26.58 
 
 
361 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  26.58 
 
 
361 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  26.58 
 
 
361 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  26.58 
 
 
361 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  26.58 
 
 
361 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  26.28 
 
 
321 aa  49.7  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  26.16 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  22.26 
 
 
372 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  24.7 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  26.13 
 
 
429 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  24.89 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  24 
 
 
314 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  24.48 
 
 
339 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  26.05 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  24.07 
 
 
290 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  25.21 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  23.45 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  29.01 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  31.13 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  25.25 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22677  dihydroderamide delta-4 desaturase  25.95 
 
 
321 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404878  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  23.55 
 
 
315 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  23.85 
 
 
387 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  27.85 
 
 
346 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  24.5 
 
 
360 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  23.64 
 
 
314 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>