More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2125 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
765 aa  1571    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  54.7 
 
 
362 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  53.85 
 
 
362 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  53.73 
 
 
363 aa  382  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  54.36 
 
 
363 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  54.12 
 
 
362 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  52.42 
 
 
358 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  48.25 
 
 
378 aa  342  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  49.54 
 
 
340 aa  340  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  47.97 
 
 
360 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  47.97 
 
 
360 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  47.67 
 
 
360 aa  336  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  46.31 
 
 
360 aa  333  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  37.12 
 
 
475 aa  323  8e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  43.87 
 
 
344 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2133  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  50.18 
 
 
409 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0420648  normal  0.988223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2541  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  49.82 
 
 
406 aa  272  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2380  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  48.19 
 
 
409 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.650264  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2704  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  45.09 
 
 
405 aa  251  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  45.45 
 
 
408 aa  247  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3559  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  45.09 
 
 
405 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3490  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  45.09 
 
 
405 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3373  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  45.45 
 
 
405 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1578  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.73 
 
 
405 aa  244  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3267  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  45.09 
 
 
405 aa  244  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0907  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.73 
 
 
405 aa  243  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0854  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.73 
 
 
405 aa  243  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0858084  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0753  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.73 
 
 
405 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2976  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.36 
 
 
405 aa  243  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.04 
 
 
411 aa  240  6.999999999999999e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3400  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  43.64 
 
 
405 aa  240  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.541196  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0095  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.4 
 
 
412 aa  239  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  45.19 
 
 
407 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3206  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.36 
 
 
405 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.619292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3577  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  42.91 
 
 
405 aa  239  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.606717  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2109  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.04 
 
 
411 aa  238  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1085  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.2 
 
 
407 aa  238  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2177  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  42.55 
 
 
412 aa  236  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00750  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  43.48 
 
 
410 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0759  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  45.09 
 
 
405 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.516373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3680  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  45.09 
 
 
405 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0438325 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0987  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  45.82 
 
 
408 aa  234  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00101326  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2876  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  45.45 
 
 
415 aa  232  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.81 
 
 
407 aa  232  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0751  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  42.55 
 
 
407 aa  231  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.013276  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0457  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  42.75 
 
 
408 aa  231  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.323552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.61 
 
 
407 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.61 
 
 
407 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0945  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  45.09 
 
 
418 aa  230  7e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0537088  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3361  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.57 
 
 
418 aa  230  8e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00861649  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0929  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.57 
 
 
418 aa  230  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.340506  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.73 
 
 
410 aa  230  8e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3433  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.57 
 
 
418 aa  230  8e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3558  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.57 
 
 
418 aa  230  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00671502  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3426  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44 
 
 
415 aa  230  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1108  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.73 
 
 
418 aa  229  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  42.96 
 
 
408 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0943  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.73 
 
 
418 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3612  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44 
 
 
415 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538206  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3098  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.73 
 
 
415 aa  229  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  43.12 
 
 
407 aa  229  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0954  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.57 
 
 
415 aa  229  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000185689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0941  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.36 
 
 
418 aa  228  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.108525  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0979  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.36 
 
 
418 aa  228  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2534  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44.36 
 
 
418 aa  228  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.508518  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03270  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  44 
 
 
407 aa  228  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  43.48 
 
 
407 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12138  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na translocating, F subunit  41.47 
 
 
434 aa  226  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0958  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  43.84 
 
 
407 aa  221  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  42.96 
 
 
407 aa  221  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3161  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  43.84 
 
 
407 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3312  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  43.84 
 
 
407 aa  219  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588875  hitchhiker  0.0000291382 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3300  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  43.84 
 
 
407 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.92794  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002712  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  43.64 
 
 
407 aa  219  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  42.59 
 
 
407 aa  216  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0036  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  40.07 
 
 
437 aa  213  7.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1879  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  43.64 
 
 
408 aa  212  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.876962  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1688  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  41.82 
 
 
407 aa  211  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0954  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  43.17 
 
 
408 aa  209  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.310824  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  37.15 
 
 
431 aa  171  4e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  32.61 
 
 
330 aa  160  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2876  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  47.2 
 
 
173 aa  153  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  32.13 
 
 
639 aa  138  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit F  31.25 
 
 
369 aa  132  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0441983  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.83 
 
 
372 aa  132  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.29 
 
 
658 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.78 
 
 
365 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2734  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52 
 
 
102 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6009  Rieske (2Fe-2S) protein  52 
 
 
102 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1457  MocE Rieske (2Fe-2S)  49 
 
 
103 aa  111  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2710  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52 
 
 
102 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332301  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2070  MocE Rieske (2Fe-2S)  52 
 
 
102 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143591  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2681  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52 
 
 
102 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 
103 aa  108  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5006  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.47 
 
 
105 aa  108  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0704074  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0616  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51 
 
 
102 aa  107  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0951  propane monoxygenase reductase  36.27 
 
 
353 aa  107  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2768  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46 
 
 
109 aa  107  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  32.84 
 
 
350 aa  104  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7184  Rieske (2Fe-2S) domain protein, MocE subfamily  46.81 
 
 
104 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00608599  normal  0.029061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>