56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2289 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2289  fatty acid desaturase  100 
 
 
359 aa  723    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345103  hitchhiker  0.00338003 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1073  fatty acid desaturase  79.22 
 
 
362 aa  563  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000383129  normal  0.912357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  47.45 
 
 
360 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  46.31 
 
 
361 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  47.08 
 
 
361 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  47.08 
 
 
361 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  46.02 
 
 
361 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  47.08 
 
 
361 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  47.08 
 
 
361 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  47.08 
 
 
361 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  47.08 
 
 
361 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  46.78 
 
 
361 aa  299  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  45.45 
 
 
361 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  46.33 
 
 
372 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  44.96 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1829  fatty acid desaturase  34.95 
 
 
349 aa  186  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  35.65 
 
 
362 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  29.78 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  25.6 
 
 
352 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  25.4 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  25.17 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  25 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  26.07 
 
 
366 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  22.59 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  23.85 
 
 
366 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  23.34 
 
 
365 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  25.1 
 
 
360 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  25.17 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  24.04 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  23.65 
 
 
469 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  24.38 
 
 
362 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  26.62 
 
 
361 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  25.93 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  23.86 
 
 
374 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  23.86 
 
 
374 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  24.56 
 
 
347 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  25.63 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  26.06 
 
 
346 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  21.65 
 
 
360 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  25.53 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  25.6 
 
 
429 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  23.65 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  23.1 
 
 
366 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  26.96 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  34.85 
 
 
364 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  24.24 
 
 
364 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  22.18 
 
 
325 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  33.33 
 
 
495 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  23.37 
 
 
376 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  28.35 
 
 
393 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  26.5 
 
 
347 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  23.36 
 
 
475 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  24.44 
 
 
362 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  23.67 
 
 
344 aa  43.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  31.71 
 
 
380 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  24.8 
 
 
426 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>